El inmueble que data de la época de la Colonia y que está localizado en la Calle Real de Pamplona, guarda parte del legado dejado por el prócer venezolano y héroe de la campaña libertadora, José Antonio Anzoátegui.
En esta casa falleció el 15 de noviembre de 1819, después de regresar victorioso de la Batalla de Boyacá, ocurrida el 7 de agosto de 1819.
En julio de 1990, los entonces presidentes de Colombia, Virgilio Barco y de Venezuela, Carlos Andrés Pérez, inauguraron el Museo que desde esa época funciona en la casona que fue restaurada por la Fundación del Patrimonio Cultural del Banco de la República.